Modlitwa to otwarcie się człowieka na Boga. W pismach św. Franciszka i jego towarzyszy znajdujemy wyjasnienie, że modlitwa to po prostu skierowanie umysłu i serca do Pana.
Każda modlitwa powinna być dla człowieka uciszeniem, uspokojeniem przed Bogiem. Powinna być spojrzeniem pełnym zachwytu dla Jego piękna, miłości, potęgi i mądrości. I właśnie tym jest modlitwa w życiu brata prenowicjusza.
W czasie rocznego prenowicjatu codziennie uczymy się odnajdywać radość i zadowolenie w najświętszych słowach Pana. Dlatego źródłem modlitwy jest dla nas adoracja Najświetszego Sakramentu, Ewangelia i Liturgia. Ponadto staramy się na wzór św. Franciszka rozważać "ksiegę Krzyża" czyniąc znak naszego zbawienia nieodzownym tłem franciszkańskiej medytacji.